Wpis z mikrobloga

@kabzior: ciekawe czy są już programy które potrafią taki genom od razu zanalizować na poszczególne fragmenty kodujące białka i te odpowiedzialne za inne funkcje, czy trzeba to robić ręcznie drogą eksperymentalną. Strzelam że pewnie na podstawie podobieństwa do innych wirusów można to w pewien sposób zautomatyzować, ale nie znam się :p
ciekawe czy są już programy które potrafią taki genom od razu zanalizować na poszczególne fragmenty kodujące białka i te odpowiedzialne za inne funkcje, czy trzeba to robić ręcznie drogą eksperymentalną.


@FLAC: @Postrzeleniec: Są takie programy, nawet dostępne online:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/orffinder/
Jak sobie wkleicie genom tego naszego gagatka, to dostaniecie całkiem sporo możliwych kandydatów takich fragmentów kodujących białka (ORF).
Ten program wyszukuje potencjalnych kandydatów i porównuje znaleziska z dostępnymi bazami
@FLAC: Gdybyś zainteresował się tematem głębiej to mam gdzieś pewnie jeszcze pełno materiałów ze studiów (niestety tylko ENG), + trochę przykładowych skryptów R / Python. Z tym że od tego czasu obawiam się że technologie poszły trochę do przodu ;)